役員・委員長・代議員一覧
| 会 長 |
| 中野 義勝 |
| 理 事 | |||
| 中野 義勝 | 波利井佐紀 | 中村 隆志 | 渡邉 敦 |
| 菅 浩伸 | 木村 匡 | 山下 洋 | |
| 監 事 | |
| 宮本 育昌 | 和田 直久 |
業務執行理事および所掌委員会委員長
| 学会誌担当理事 | 波利井 佐紀 |
| 学会誌編集委員長 | 深見 裕伸 |
| 広報・社会連携担当理事 | 中村 隆志 |
| 広報委員長 | 樋口 富彦 |
| 教育・普及啓発委員長 | 中村 隆志 |
| 学会戦略・国際連携担当理事 | 渡邉 敦 |
| 学会戦略委員長 | 山野 博哉 |
| 国際連携委員長 | 渡邉 敦 |
| サンゴ礁保全・調査安全担当理事 | 菅 浩伸 |
| サンゴ礁保全学術委員長 | 藤田 喜久 |
| 調査安全委員長 | 菅 浩伸 |
| 庶務・会計担当理事 | 木村 匡 |
| 賞委員長 | 藤田 和彦 |
| 選挙管理委員長 | 目崎 拓真 |
| 事務局長 | 水山 克 |
| 大会担当理事 | 山下 洋 |
| 第27回大会実行委員長 | 深見 裕伸 |
| 第28回大会実行委員長 | 波利井佐紀 |
各委員会委員 **委員長 *副委員長
| 学会誌編集委員会 | |||
| 深見 裕伸** | 中村 崇* | 井口 亮 | Casareto, Beatriz E. |
| 栗原 晴子 | 小池 一彦 | 里見 龍樹 | Sinniger, Frederic |
| 藤田 和彦 | 藤村 弘行 | Baird, Andrew | 野澤 洋耕 |
| 山崎 敦子 | 渡邊 剛 | ||
| 英文誌編集委員会 ⁺⁺編集長 ⁺副編集長 （分野別編集幹事） | |
| 栗原 晴子（生物分野） | 小池 一彦（生物分野） |
| 野澤 洋耕⁺（生態分野） | Baird, Andrew（生態分野） |
| 深見 裕伸⁺⁺（多様性分野） | Sinniger, Frederic⁺（多様性分野） |
| 山崎 敦子（環境・保全分野） | 藤田 和彦（地質・地理分野） |
| 里見 龍樹（人文科学分野） | Casareto, Beatriz E.⁺（生物地球化学分野） |
| 菅 浩伸 | Cortes, Jorge |
| Sylvain, Agostini | 新里 宙也 |
| Danwei, Huang | 畑 啓生 |
| 波利井佐紀 | 本郷 宙軌 |
| 安田 仁奈 | 山野 博哉 |
| 和文誌編集委員会 ⁺⁺編集長 ⁺副編集長 （分野別編集幹事） | |
| 井口 亮（生物分野） | 中村 崇⁺⁺（生態分野） |
| 深見 裕伸（多様性分野） | 渡邊 剛（環境・保全分野） |
| 藤田 和彦（地質・地理分野） | 藤村 弘行⁺（生物地球化学分野） |
| 里見 龍樹（人文科学分野） | |
| 井龍 康文 | 鹿熊 信一郎 |
| 菅 浩伸 | 久保田 賢 |
| 小池 一彦 | 佐藤 崇範 |
| 新里 宙也 | 中野 義勝 |
| 野澤 洋耕 | 山野 博哉 |
| 広報委員会 | |||
| 樋口 富彦** | 本郷 宙軌* | 山下 洋* | 柏本 理緒 |
| 岨 康輝 | 髙木 俊幸 | 田中 健太郎 | 藤井 琢磨 |
| 山本 将史 | 湯山 育子 | 善岡 祐輝 | 和田 直久 |
| 教育・普及啓発委員会 | |||
| 中村 隆志** | 水山 克* | 安田 仁奈* | 井口 亮 |
| 梅澤 有 | 北野 裕子 | 栗原 晴子 | 佐藤 崇範 |
| 高倉 葉太 | 津田 和忠 | 土川 仁 | 中島 祐一 |
| 中野 和真 | 浪崎 直子 | 濱本 耕平 | 廣瀬 慎美子 |
| 古川 真央 | |||
| 学会戦略委員会 | |||
| 山野 博哉** | 菅 浩伸 | 木村 匡 | 中野 義勝 |
| 中村 隆志 | 波利井 佐紀 | 樋口 富彦 | 深見 裕伸 |
| 藤田 和彦 | 藤田 喜久 | 水山 克 | 目崎 拓真 |
| 山下 洋 | 渡邉 敦 | ||
| 国際連携委員会 | |||
| 渡邉 敦** | 井龍 康文 | 木村 匡 | Sylvain, Agostini |
| 鈴木 利幸 | 中村 隆志 | 野澤 洋耕 | 宮本 育昌 |
| Reimer, James D. | |||
| サンゴ礁保全学術委員会 | |||
| 藤田 喜久** | 安部 真理子 | 井口 亮 | 岡地 賢 |
| 木村 匡 | 佐々木 小枝 | 長田 智史 | 中井 達郎 |
| 中野 義勝 | 中村 隆志 | 中村 崇 | 深見 裕伸 |
| 宮本 育昌 | 目崎 拓真 | 安田 仁奈 | 山崎 敦子 |
| 山野 博哉 | |||
| 調査安全委員会 | |||
| 菅 浩伸** | 鈴木 倫太郎 | 中井 達郎 | 中野 義勝 |
| 中村 崇 | 福岡 幸二 | 水口 裕尊 | 目崎 拓真 |
| 森松 嘉孝 | |||
| 賞委員会 | |
| 藤田 和彦** | 梅澤 有* |
| 選挙管理委員会 | |
| 目﨑 拓真** | 和田 直久 |
| 第27回大会実行委員会 | |||
| 深見 裕伸** | 安田 仁奈 | 北野 裕子 | |
| 第28回大会実行委員会 | |||
| 波利井佐紀** | 石田 純 | 磯村 尚子 | Sinniger, Frederic |
| 高橋 俊一 | 野澤 洋耕 | 野中 正法 | 水山 克 |
| 和田 直久 | |||
代議員（五十音順）
| 磯村 尚子 | 梅澤 有 | 栗原 晴子 | 新里 宙也 |
| 鈴木 豪 | 中村 崇 | 中村 隆志 | 野澤 洋耕 |
| 波利井 佐紀 | 樋口 富彦 | 深見 裕伸 | 本郷 宙軌 |
| 目﨑 拓真 | 安田 仁奈 | Reimer, James | |
| （15名） | |||
名誉会員（五十音順）
| 近森 正 | 土屋 誠 | 西平 守孝 | 堀 信行 |
歴代会長（法人化以前を含む）
| 山里 清（1997-2005） | 小西 健二（2005-2007） | 西平 守孝（2007-2009） |
| 土屋 誠（2009-2013） | 鈴木 款（2013-2017） | 日高 道雄（2017-2020） |
| 山野 博哉（2020-2023） |
